本校初籌於民國五十三年十月，在創辦人李正合先生及其夫人閔蓉蓉女士大力奔走下，擇地於台南縣永康市大灣裡即古稱「鯽魚潭」故址，從一片荒蕪中，篳路藍縷、胼手胝足，用心灌溉教育，於民國五十四年四月二十九日創校。

創校之初，原申請設立工商專科學校，後經教育部核定為「崑山工業專科學校」。民國六十年八月，本校奉教育部核准設立二年制夜間部。民國八十年八月增設商科，復更名為「崑山工商專科學校」。由於辦學績優，民國八十五年八月，奉教育部核定第一批改制為技術學院，並附設專科部；夜間部亦同時改制為「進修推廣部」。

民國八十九年奉教育部核定改名為科技大學。現有工程、商業管理、創意媒體、人文科學及資訊科技等五個學院。全校學生總數約一萬四千名，教職員工五百餘人。

現有系所分配

1. 研究所：
   • 博士班：機械與能源工程研究所
   • 碩士班：電子工程研究所、電機工程研究所、機械工程研究所、環境工程研究所、光電工程研究所、綠色材料研究所、企業管理研究所、視覺傳達設計所、媒體藝術研究所、資訊管理研究所、數位生活科技研究所
   • 在職專班：電子工程研究所、電機工程研究所、機械工程研究所、環境工程研究所、綠色材料研究所、企業管理研究所、視覺傳達設計所、數位生活科技研究所
2. 日間部：
   • 四技部：二十一系一個組
   • 二技部：一系
3. 進修部：
   • 二技部：二系(進修部)
   • 四技部：二十系一組(進修部)
   • 二技部：八系(在職專班)
   • 四技部：三系(在職專班)
   • 二技部：十一系(進修學院)
4. 二年制進修專校：
   • 十一科

本校創校已屆 45 年，校園寬廣、環境優美、黌宮巍然，矗立南都，作育英才，蜚聲中外。多年來，配合政府建立技職教育體系之政策，在現有基礎上穩健經營、踏實辦學，兼顧大學教育與技職教育之整合，同時因應國家經濟建設，依循產業發展方向，教授應用科學及技術服務，培養具備人文精神中心內涵的工程、管理、商業及設計高級人才，並積極辦理推廣教育，提供業界專業人員在職進修及研究發展機會，使產學結合，成為一流科技大學。邁向二十一世紀後，期許更能快速穩健發展，躋身國際一流學府。